保护区地处长江和黄河的上游源头地区，平均海拔约4500米，是长江和黄河的重要的水源涵养地。保护区总面积近67万公顷，涉及五个乡镇（长沙贡玛、呷依、宜牛、新荣、格孟），2013年全国第二次湿地资源调查中，保护区拥有各类湿地（河流、沼泽、湖泊）总面积18万余公顷，占保护区总面积的27%。
保护区主要保护对象为高寒湿地生态系统及藏野驴等珍稀濒危野生动物。据统计，境内分布有脊椎动物208种（国家一级保护16种，二级保护32种），维管植物441种。
2019年，石渠县成立了长沙贡玛国家级自然保护区服务中心，配齐工作人员，落实工作经费。石渠县林草局局长曲多介绍，目前已完成保护区一期建设，包括2个保护站、3个保护点、300个左右界桩、5座瞭望塔、3个指路牌和25公里巡护道路。
