祭祀焚烧产生烟气和香味的植物
祭祀行为在植物遗存方面也有所体现。远古时期的祭祀方法很多，其中“燎祭”是极其重要的一种祭祀仪式。据《礼记·祭法》中记载：“燔柴于泰坛者，谓积薪于坛而取玉及牲置柴上燔之，使气达于天也。”《吕氏春秋·季冬》高诱注：“燎者，积聚柴薪，置壁与牲于上而燎之，升其烟气。”
燎祭需要“积聚柴薪”。祭祀区大量炭屑的发现，被认为与祭祀活动密切相关。“炭屑含量可以反映一个地方的用火行为，能看出用火的频繁程度和用火规模。”姜铭说，与成都平原同时期其他地点相比，金沙遗址祭祀区的炭屑含量非常高，特别是到了第三期中段，炭屑含量丰富程度令人瞩目。而且，这些炭屑大部分来自地层，表明先民们用火频率很高，可能反映了该地点在商周时期祭祀活动比较频繁。
樱属种子燎祭需要“升其烟气”，以达于天。这种祭祀活动对燃料也有一些讲究，除了选择能够产生大量烟雾的材料，很可能也会燃烧一些含有香气的植物。因为祭祀的目的在于通神，而香气被认为是通神的媒介。祭祀区的发现也证实了这一点，其中樟树、花椒等都是可以产生香味的材料。
除此以外，金沙遗址祭祀区还存在大量树木类遗存，“这是成都平原同时期其他遗址中从未有过的现象，令人瞩目，表明附近可能存在较多林地。”多种水生杂草种子的存在，反映了当时存在多水的环境，与古河道可能存在着一定关联。
目前，关于金沙遗址祭祀区的植物考古仍在进行。管中窥豹，不难看出金沙时期的古蜀社会极具规模的神权体系和宗教意识。
